Optimization of FRET algorithms for sensitized-emission FRET detection

Sheng Wang; Qiong Wu; Zichun Hua

doi:10.3788/col201210.071701

[1] M. C. Dinger, J. E. Bader, A. D. Kobor, A. K. Kretzschmar, and A. G. Beck-Sickinger, J. Biol. Chem. 278, 10562 (2003).

[2] K. Truong and M. Ikura, Curr. Opin. Struc. Biol. 11, 573 (2001).

[3] S. Qiu, Y. Hua, F. Yang, Y. Chen, and J. Luo, J. Biol. Chem. 280, 24923 (2005).

[4] L. Song, E. J. Hennink, I. T. Young, and H. J. Tanke, Biophys. Jouranl 68, 2588 (1995).

[5] C. L. Takanishi, E. A. Bykova, W. Cheng, and J. Zheng, Brain Res. 1091, 132 (2006).

[6] Y. Chen, J. D. Mills, and A. Periasamy, Differentiation 71, 528 (2003).

[7] C. Barney and G. Danuser, Biophys. Jouranl 84, 3992 (2003).

[8] Z. Xia and Y. Liu, Biophys. Journal 81, 2395 (2001).

[9] G. W. Gordon, G. Berry, X. H. Liang, B. Levine, and B. Herman, Biophys. Journal 74, 2702 (1998).

[10] M. G. Erickson, B. A. Alseikhan, B. Z. Peterson, and D. T. Yue, Neuron 31, 973 (2001).

[11] E. G. D. Muller, B. E. Snydsman, I. Novik, D. W. Hailey, D. R. Gestaut, C. A. Niemann, E. T. O'Toole, T. H. Giddings, Jr., B. A. Sundin, and T. N. Davis, Mol. Biol. Cell 16, 3341 (2005).

[12] Z. Xia, Q. Zhou, J. Lin, and Y. Liu, J. Biol. Chem. 276,1766 ( 2001).

[13] F. Zhang, G. Fu, C. Wang, L. Cao, H. Yang, G. Wang,Y. Chen, and C. He, Mol. Imaging Biol. 11, 188 (2009).

[14] D. C. Youvan, C. M. Silva, E. J. Bylina, W. J. Coleman,M. R. Dilworth, and M. M. Yang, Biotechnology 3, 1(1997).

[15] T. Sorkina, S. Doolen, E. Galperin, N. R. Zahniser, andA. Sorkin, J. Biol. Chem. 278, 28274 (2003).

[16] R. N. Day, A. Periasamy, and F. Schaufele, Methods. 25,4 (2001).

[17] G. Fu, H. Yang, C. Wang, F. Zhang, Z.You, G. Wang,C. He, Y. Chen, and Z. Xu, Biochem. Biophys. Res.Commun. 346, 986 (2006).

[18] M. Elangovan, W. Horst, Y. Chen, R. N. Day, M. Barroso, and A. Periasamy, Methods 29, 58 (2003).

[19] M. A. Rizzo, G. H. Springer, B. Granada, and D. W. Piston, Nat. Biotechnol. 22, 445 (2004).

[20] B. C. Barnhart, J. C. Lee, E. C. Alappat, and M. E. Peter, Oncogene 22, 8634 (2003).

[21] R. M. Siegel, D. A. Martin, L. Zheng, S. Y. Ng, J. Bertin, J. Cohen, and M. J. Lenardo, J. Cell. Biol. 141, 1243(1998).